La harina de pescado es fundamental en la alimentación de peces y crustáceos en la acuicultura. Es el enlace entre las actividades pesqueras y acuícolas del Ecuador. Usualmente, la producción de la harina se realiza en varias etapas: cocción, prensado, secado, enfriado, molienda y finalmente envasado. El resultado es un alimento rico en energía y proteínas y con una alta proporción de aminoácidos esenciales.
El aceite de pescado es un líquido de color marrón/amarillento oscuro dependiendo de la especie de peces. Bajo un tratamiento de temperaturas y filtrados se puede obtener el aceite, Se utiliza en formulaciones de alimentos balanceados para camarones, industria de las pinturas, en productos alimenticios.
En el proceso de fabricación de harina de pescado, se obtiene un producto llamado soluble de pescado, con una concentración de 40º brix. El soluble de pescado es utilizado en la agricultura orgánica y en la alimentación animal debido a que contiene un alto porcentaje de proteína soluble..
El componente mas nutritivo de la harina de pescado es la proteína, la cual tiene una proporción ideal de aminoácidos esenciales altamente digestibles, que varían relativamente poco con el origen de la harina. Además la proteína de la harina de pescado tiene una escasa antigenicidad, por lo que resulta muy adecuada en dietas alimenticias.